La chiesa Santa Maria della Spina, originariamente chiamata Santa Maria di Pontenovo è un altro punto di riferimento religioso a Pisa, il cui principale merito è il fatto che la chiesa si afferma come una delle più belle espressioni dello stile gotico. In effetti, l'edificio non impressiona per le sue dimensioni ma con la sua architettura e gli oggetti d'arte decorativa che vanno dai cuspidi del tetto, tamburelli e tabernacoli alle varie sculture di Andrea Pisano, Nino Pisano, Tommaso Pisano, Lupo di Francesco e Giovanni di Balduccio.
A differenza del esterno rivestito di marmi policromi e ricche decorazioni, l'interno della chiesa di Santa Maria della Spina è abbastanza austero, ma sicuramente vale la pena esplorare questo edificio religioso. Una curiosità sulla chiesa di Santa Maria della Spina è che attualmente non non si trova nel luogo dove è stata originariamente costruita nel 1230. A causa dei cedimenti del terreno e alla vicinanza del fiume Arno, la chiesa fu smantellata e poi ricostruita in un luogo più elevato. Il nome Spina della chiesa è dovuto al fatto che conservava una spina della corona indossata da Gesù nel momento della crocefissione, portata qui nel XIV secolo, e poi custodita nella chiesa di Santa Chiara.